尼山书院位于尼山孔庙东北隅，原为尼山书院学录的办公处所。元至元二年（1336年），中书左丞王懋德奏请在尼山创建书院，并保举彭璠为山长，创建尼山书院。

    元朝末年，尼山书院败落，至明永乐十五年（1417年）有五十九代衍圣公孔彦缙发起重修，弘治七年（1494年）六十一代衍圣公孔弘绪、四氏学学录孔公璜再次修建。历史上也将整个尼山古建筑群总称为尼山书院。   

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